车辆违章扣分的处理流程如下：
携带证件：
车主需携带个人驾驶证和车辆行驶证前往当地交警大队或车管所。
提交材料：
在交警大队或车管所的违章处理窗口，车主需提交相关材料以进行违章业务处理。
查询记录：
请求工作人员查询驾驶证分数和车辆的具体违章记录，包括违章次数、扣除的分数以及罚款金额。
确认处理：
确认并处理完所有违章后，车主将获得一份交通违章缴款单，需签字确认并在签字栏下方注明“无异议”。
缴纳罚款：
根据缴款单上的金额，车主需在指定银行完成罚款的缴纳。
若驾驶证扣分满12分，驾驶人需按照《机动车驾驶证申领和使用规定》的要求进行处理：
1. 在十五日内到机动车驾驶证核发地或违法行为地公安机关交通管理部门参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。
2. 完成学习后，需在二十日内参加道路交通安全法律、法规和相关知识考试（科目一）。
3. 若考试合格，记分将被清除，并重新发还机动车驾驶证；若考试不合格，则需继续参加学习和考试。
建议：
尽量提前处理违章扣分，以免产生滞纳金。
可以通过“交管12123”APP或自助处理终端处理罚款金额在200元及以下且累计记分不满12分的违章。
若扣分超过12分，需参加科目一和科目三的考试，合格后才能拿回驾驶证。
